Era el patriarcado más importante de la antigua Iglesia de Oriente. Separado de la unidad por el monofisismo surgió en él la Iglesia copta.

Los melquitas se separaron de Roma en el siglo XI siguiendo a Constantinopla.

Esta Iglesia fue casi destruida por la dominación musulmana.

En el siglo XVI recomenzó a mejorar bajo la dirección de patriarcas competentes hasta mediados del siglo XVIII.

Pero a mediados del XIX, bajo la dominación de los turcos, el patriarcado volvió a desaparecer prácticamente, reducido materialmente a dos monasterios y diez edificios eclesiásticos.

En el siglo XX comenzó otra renovación.

A mediados del siglo contaba con 150.000 fieles, con 100 iglesias y unos 120 sacerdotes.