La comunidad más antigua de la Iglesia dejó de existir por la destrucción de Jerusalén el año 70.

Reapareció en el siglo II, constituida bajo la jurisdicción de Antioquía. Pero por su antiguedad fue recibiendo titulos y jurisdicciones de la Iglesia universal.

Fueron fieles en Calcedonia contra el monofisismo.

En 614 sufrieron la conquista de los persas con la destrucción del Santo Sepulcro y el robo de la Cruz de Cristo.

El año 630 el Emperador Heraclio venció a los persas y recuperó la Cruz, pero fue atacado por sorpresa por los árabes y sucumbió dejando sin defensas la zona oriental del Imperio. Entonces se extendió la oleada islámica.

El 637 los árabes conquistaron Jerusalén. A comienzos del siglo XI, bajo el Califato de Egipto recomenzaron las persecuciones y de nuevo destruyeron los Santos Lugares.

El Patriarcado se unió al Cisma de Miguel Cerulario. Contaba con unos 60.000 fieles en Palestina y Jordania. La Iglesia autocéfala del Sinaí.

Es la Iglesia independiente más pequeña de la cristiandad.

En realidad, es un monasterio: Santa Catalina, a los pies del Djebel Musa, con los beduinos que habitan ese territorio. Fue fundado por Justiniano en el 527.

En el siglo VII el abad recibió el título de Obispo de Phanar, Sinaí y Raiths. En 1575 fue proclamado Iglesia autocéfala.

El abadarzobispo recibe la consagración del patriarca de Jerusalén.